Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGFO15240 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGFO15240 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGFO15240 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VGFO15240 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VGFO15240 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms