Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBDO15205 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBDO15205 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms