Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms