Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms