Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PMD0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PMD0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PMD0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PMD0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PMD0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms