Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms