Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCP1A6NGW2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRCP1A6NGW2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms