Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17190V9GX38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm17190V9GX38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm17190V9GX38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm17190V9GX38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms