Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4s1Q9WVL1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap4s1Q9WVL1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap4s1Q9WVL1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms