Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slco1c1Q9ERB5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1c1Q9ERB5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slco1c1Q9ERB5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 384.3 ms