Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms