Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RTKNQ9BST9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTKNQ9BST9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTKNQ9BST9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTKNQ9BST9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms