Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPNQ96H22 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPNQ96H22 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPNQ96H22 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms