Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDCSPQ8NFU4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDCSPQ8NFU4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDCSPQ8NFU4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDCSPQ8NFU4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDCSPQ8NFU4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FDCSPQ8NFU4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDCSPQ8NFU4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDCSPQ8NFU4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FDCSPQ8NFU4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms