Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.72
NischQ80TM9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
NischQ80TM9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.77■■■■■ 5.72
NischQ80TM9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.76■■■■■ 5.72
NischQ80TM9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC50.74■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC50.73■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC50.71■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC50.7■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC50.68■■■■■ 5.7
NischQ80TM9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC50.68■■■■■ 5.7
NischQ80TM9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
NischQ80TM9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
NischQ80TM9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC50.62■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC50.6■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC50.55■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC50.53■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC50.5■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.49■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC50.49■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC50.48■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC50.46■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC50.45■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.45■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC50.44■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC50.43■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC50.41■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC50.38■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC50.38■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC50.36■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC50.32■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC50.31■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC50.29■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC50.27■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.27■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC50.26■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC50.25■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC50.22■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC50.21■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC50.19■■■■■ 5.63
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