Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.72
NischQ80TM9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
NischQ80TM9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.77■■■■■ 5.72
NischQ80TM9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.76■■■■■ 5.72
NischQ80TM9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC50.74■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC50.73■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC50.71■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC50.7■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
NischQ80TM9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC50.68■■■■■ 5.7
NischQ80TM9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC50.68■■■■■ 5.7
NischQ80TM9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
NischQ80TM9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
NischQ80TM9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC50.62■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC50.6■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
NischQ80TM9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC50.55■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC50.53■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
NischQ80TM9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC50.5■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.49■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC50.49■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC50.48■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC50.46■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC50.45■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.45■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC50.44■■■■■ 5.67
NischQ80TM9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC50.43■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC50.41■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC50.38■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC50.38■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
NischQ80TM9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC50.36■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC50.32■■■■■ 5.65
NischQ80TM9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC50.31■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC50.29■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC50.27■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.27■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC50.26■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
NischQ80TM9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC50.25■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC50.22■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC50.21■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
NischQ80TM9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC50.19■■■■■ 5.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms