Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf250Q7TNU6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf250Q7TNU6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf250Q7TNU6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf250Q7TNU6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms