Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ift20Q61025 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ift20Q61025 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift20Q61025 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms