Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp7Q60973 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp7Q60973 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rbbp7Q60973 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp7Q60973 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms