Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlha9Q5RJB0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlha9Q5RJB0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlha9Q5RJB0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms