Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcgf5Q3UK78 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcgf5Q3UK78 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcgf5Q3UK78 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms