Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nom1Q3UFM5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nom1Q3UFM5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nom1Q3UFM5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nom1Q3UFM5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nom1Q3UFM5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms