Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 REV7YIL139C 738 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 HCR1YLR192C 798 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YLR366WYLR366W 306 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 PET8YNL003C 855 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 ESC2YDR363W 1371 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 HVG1YER039C 750 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 DDI1YER143W 1287 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 SPO12YHR152W 522 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 PHO23YNL097C 993 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 DIG1YPL049C 1359 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 AGP3YFL055W 1677 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YCR025CYCR025C 411 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YGL235WYGL235W 537 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 MRP7YNL005C 1116 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 MTQ1YNL063W 945 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 END3YNL084C 1050 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YPL251WYPL251W 303 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 NBA1YOL070C 1506 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 DPB2YPR175W 2070 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 PAF1YBR279W 1338 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 VAC17YCL063W 1272 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 MRP13YGR084C 1020 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 SCEIQ0160 708 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YHL045WYHL045W 348 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YJR096WYJR096W 849 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 XPT1YJR133W 630 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 SHB17YKR043C 816 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 RNH1YMR234W 1047 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 ALG5YPL227C 1005 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YPS3YLR121C 1527 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 TOK1YJL093C 2076 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 INM1YHR046C 888 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 DCG1YIR030C 735 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 SBA1YKL117W 651 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YLR202CYLR202C 327 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YMR181CYMR181C 465 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 TOM6YOR045W 186 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 ARO10YDR380W 1908 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 CLD1YGR110W 1338 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 GND2YGR256W 1479 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 SED1YDR077W 1017 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 CWP2YKL096W-A 279 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 TAP42YMR028W 1101 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 CSG2YBR036C 1233 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 BRR1YPR057W 1026 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-DR3Q12441 YPL245WYPL245W 1365 nt7.84□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 SFA1YDL168W 1161 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 GEP7YGL057C 864 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 ARI1YGL157W 1044 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 MOB1YIL106W 945 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 YML089CYML089C 369 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 TOA2YKL058W 369 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 GAL2YLR081W 1725 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 OST3YOR085W 1053 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 CLB4YLR210W 1383 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 SNU71YGR013W 1863 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 MTG2YHR168W 1557 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 HEM13YDR044W 987 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 EAF5YEL018W 840 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 YGR291CYGR291C 222 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 AIM23YJL131C 1071 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 YLR407WYLR407W 687 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 VPS68YOL129W 555 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 ARG7YMR062C 1326 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 DAK2YFL053W 1776 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 OPI1YHL020C 1215 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 HYM1YKL189W 1200 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 SDS22YKL193C 1017 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 SAM1YLR180W 1149 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 LSR1LSR1 1175 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 TIF6YPR016C 738 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 VPS62YGR141W 1404 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 FET5YFL041W 1869 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 YDL086WYDL086W 822 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 YDR222WYDR222W 1248 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 MGM101YJR144W 810 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 ERJ5YFR041C 888 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 MTR2YKL186C 555 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 YNL171CYNL171C 369 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 RUF5-1RUF5-1 710 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 RUF5-2RUF5-2 710 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 HRT1YOL133W 366 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 THI80YOR143C 960 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 SPO77YLR341W 1434 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-DR3Q12441 LSM6YDR378C 261 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YAR028WYAR028W 705 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 IBD2YNL164C 1056 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 MSO1YNR049C 633 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 MRPL23YOR150W 492 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 YCR016WYCR016W 873 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-DR3Q12441 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.76□□□□□ -1.17
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