Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

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Length 1,223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 KAE1YKR038C 1161 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 NDE2YDL085W 1638 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 ECM10YEL030W 1935 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 ATP2YJR121W 1536 nt8.85□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 GDH1YOR375C 1365 nt8.85□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.84□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.84□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.84□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.84□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.84□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.84□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.84□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 YJL211CYJL211C 444 nt8.84□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 PRE10YOR362C 867 nt8.84□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 ABP1YCR088W 1779 nt8.84□□□□□ -1
GDE1Q02979 HXT8YJL214W 1710 nt8.83□□□□□ -1
GDE1Q02979 MGM101YJR144W 810 nt8.83□□□□□ -1
GDE1Q02979 YJL045WYJL045W 1905 nt8.83□□□□□ -1
GDE1Q02979 ELP4YPL101W 1371 nt8.83□□□□□ -1
GDE1Q02979 TIM50YPL063W 1431 nt8.82□□□□□ -1
GDE1Q02979 TAD2YJL035C 753 nt8.82□□□□□ -1
GDE1Q02979 TDH1YJL052W 999 nt8.82□□□□□ -1
GDE1Q02979 PMU1YKL128C 888 nt8.82□□□□□ -1
GDE1Q02979 YGR137WYGR137W 375 nt8.81□□□□□ -1
GDE1Q02979 YIL168WYIL168W 384 nt8.81□□□□□ -1
GDE1Q02979 DIP5YPL265W 1827 nt8.81□□□□□ -1
GDE1Q02979 JHD1YER051W 1479 nt8.81□□□□□ -1
GDE1Q02979 ALD5YER073W 1563 nt8.81□□□□□ -1
GDE1Q02979 YIL177CYIL177C 5277 nt8.81□□□□□ -1
GDE1Q02979 TDA4YJR116W 840 nt8.8□□□□□ -1
GDE1Q02979 EEB1YPL095C 1371 nt8.8□□□□□ -1
GDE1Q02979 WSC3YOL105C 1671 nt8.79□□□□□ -1
GDE1Q02979 MIM1YOL026C 342 nt8.79□□□□□ -1
GDE1Q02979 TGL5YOR081C 2250 nt8.78□□□□□ -1
GDE1Q02979 TOS1YBR162C 1368 nt8.78□□□□□ -1
GDE1Q02979 SWP1YMR149W 861 nt8.78□□□□□ -1
GDE1Q02979 GLY1YEL046C 1164 nt8.77□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 YNL140CYNL140C 570 nt8.77□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 ORT1YOR130C 879 nt8.77□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 TIF3YPR163C 1311 nt8.77□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 INM1YHR046C 888 nt8.76□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 MRP7YNL005C 1116 nt8.75□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 YOR268CYOR268C 399 nt8.75□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 HMT1YBR034C 1047 nt8.75□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 ECM27YJR106W 2178 nt8.74□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 STF1YDL130W-A 261 nt8.74□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 YOR072WYOR072W 315 nt8.74□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 ALG7YBR243C 1347 nt8.74□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 HDA1YNL021W 2121 nt8.74□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 HBS1YKR084C 1836 nt8.73□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 ARO3YDR035W 1113 nt8.73□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 GUT1YHL032C 2130 nt8.73□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 MRN1YPL184C 1839 nt8.73□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 ADE1YAR015W 921 nt8.72□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 ARG7YMR062C 1326 nt8.72□□□□□ -1.01
GDE1Q02979 NUP53YMR153W 1428 nt8.71□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 WSC4YHL028W 1818 nt8.7□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 SNP1YIL061C 903 nt8.69□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 YJL043WYJL043W 774 nt8.68□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 MNN9YPL050C 1188 nt8.68□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 EDC2YER035W 438 nt8.67□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 PSP2YML017W 1782 nt8.67□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 APT1YML022W 564 nt8.67□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 YPL277CYPL277C 1464 nt8.67□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 snR4snR4 186 nt8.66□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 PZF1YPR186C 1290 nt8.65□□□□□ -1.02
GDE1Q02979 KTR4YBR199W 1395 nt8.64□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 HAC1YFL031W 717 nt8.64□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 PET494YNR045W 1470 nt8.64□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 SPR1YOR190W 1338 nt8.62□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 FUS3YBL016W 1062 nt8.62□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 MFG1YDL233W 1377 nt8.61□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 MTC6YHR151C 1581 nt8.61□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 PNS1YOR161C 1620 nt8.61□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 MEX67YPL169C 1800 nt8.61□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 YDR476CYDR476C 675 nt8.6□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 BUR6YER159C 429 nt8.6□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 CPT1YNL130C 1182 nt8.6□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 YPL071CYPL071C 471 nt8.6□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 BAP3YDR046C 1815 nt8.59□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 DIA4YHR011W 1341 nt8.59□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 DST1YGL043W 930 nt8.59□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 RRT6YGL146C 936 nt8.59□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 COX16YJL003W 357 nt8.59□□□□□ -1.03
GDE1Q02979 ELP6YMR312W 822 nt8.58□□□□□ -1.04
GDE1Q02979 YKR023WYKR023W 1593 nt8.57□□□□□ -1.04
GDE1Q02979 MAK32YCR019W 1092 nt8.57□□□□□ -1.04
GDE1Q02979 PRE5YMR314W 705 nt8.57□□□□□ -1.04
GDE1Q02979 LPD1YFL018C 1500 nt8.57□□□□□ -1.04
GDE1Q02979 CPR2YHR057C 618 nt8.56□□□□□ -1.04
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