Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpm2P58774 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm2P58774 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm2P58774 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tpm2P58774 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms