Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli1P47806 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli1P47806 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli1P47806 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli1P47806 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli1P47806 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli1P47806 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli1P47806 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli1P47806 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli1P47806 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli1P47806 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli1P47806 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli1P47806 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli1P47806 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli1P47806 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli1P47806 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli1P47806 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli1P47806 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms