Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msh2P43247 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msh2P43247 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msh2P43247 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh2P43247 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh2P43247 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh2P43247 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msh2P43247 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Msh2P43247 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh2P43247 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh2P43247 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh2P43247 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh2P43247 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh2P43247 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msh2P43247 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms