Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 INH1YDL181W 258 nt10.15□□□□□ -0.78
CSE4P36012 YBL095WYBL095W 813 nt10.15□□□□□ -0.78
CSE4P36012 PRE10YOR362C 867 nt10.15□□□□□ -0.78
CSE4P36012 YDR306CYDR306C 1437 nt10.15□□□□□ -0.79
CSE4P36012 YHP1YDR451C 1062 nt10.14□□□□□ -0.79
CSE4P36012 SPR1YOR190W 1338 nt10.13□□□□□ -0.79
CSE4P36012 MRS4YKR052C 915 nt10.13□□□□□ -0.79
CSE4P36012 AIM41YOR215C 558 nt10.13□□□□□ -0.79
CSE4P36012 YMC2YBR104W 990 nt10.13□□□□□ -0.79
CSE4P36012 PNS1YOR161C 1620 nt10.13□□□□□ -0.79
CSE4P36012 MAE1YKL029C 2010 nt10.12□□□□□ -0.79
CSE4P36012 YJL009WYJL009W 327 nt10.12□□□□□ -0.79
CSE4P36012 NCA3YJL116C 1014 nt10.12□□□□□ -0.79
CSE4P36012 IDP3YNL009W 1263 nt10.12□□□□□ -0.79
CSE4P36012 CYT1YOR065W 930 nt10.12□□□□□ -0.79
CSE4P36012 PZF1YPR186C 1290 nt10.12□□□□□ -0.79
CSE4P36012 ATG22YCL038C 1587 nt10.12□□□□□ -0.79
CSE4P36012 PUS7YOR243C 2031 nt10.11□□□□□ -0.79
CSE4P36012 MEP1YGR121C 1479 nt10.1□□□□□ -0.79
CSE4P36012 HXT8YJL214W 1710 nt10.1□□□□□ -0.79
CSE4P36012 ESBP6YNL125C 2022 nt10.09□□□□□ -0.79
CSE4P36012 LSM12YHR121W 564 nt10.09□□□□□ -0.79
CSE4P36012 DOC1YGL240W 753 nt10.08□□□□□ -0.8
CSE4P36012 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt10.08□□□□□ -0.8
CSE4P36012 APT1YML022W 564 nt10.08□□□□□ -0.8
CSE4P36012 EHT1YBR177C 1356 nt10.08□□□□□ -0.8
CSE4P36012 FET5YFL041W 1869 nt10.07□□□□□ -0.8
CSE4P36012 PIH1YHR034C 1035 nt10.07□□□□□ -0.8
CSE4P36012 TPN1YGL186C 1740 nt10.07□□□□□ -0.8
CSE4P36012 BNA3YJL060W 1335 nt10.07□□□□□ -0.8
CSE4P36012 AAT1YKL106W 1356 nt10.06□□□□□ -0.8
CSE4P36012 GET2YER083C 858 nt10.06□□□□□ -0.8
CSE4P36012 LRO1YNR008W 1986 nt10.06□□□□□ -0.8
CSE4P36012 SIR2YDL042C 1689 nt10.06□□□□□ -0.8
CSE4P36012 MTO1YGL236C 2010 nt10.05□□□□□ -0.8
CSE4P36012 SLM3YDL033C 1254 nt10.03□□□□□ -0.8
CSE4P36012 URA1YKL216W 945 nt10.03□□□□□ -0.8
CSE4P36012 YLR072WYLR072W 2082 nt10.03□□□□□ -0.8
CSE4P36012 LAT1YNL071W 1449 nt10.01□□□□□ -0.81
CSE4P36012 OCA1YNL099C 717 nt10.01□□□□□ -0.81
CSE4P36012 MRS3YJL133W 945 nt10□□□□□ -0.81
CSE4P36012 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt10□□□□□ -0.81
CSE4P36012 PCL10YGL134W 1302 nt10□□□□□ -0.81
CSE4P36012 snR86snR86 1004 nt9.99□□□□□ -0.81
CSE4P36012 ATP23YNR020C 813 nt9.99□□□□□ -0.81
CSE4P36012 CRN1YLR429W 1956 nt9.99□□□□□ -0.81
CSE4P36012 TRP2YER090W 1524 nt9.98□□□□□ -0.81
CSE4P36012 MCM5YLR274W 2328 nt9.98□□□□□ -0.81
CSE4P36012 TPO4YOR273C 1980 nt9.97□□□□□ -0.81
CSE4P36012 MPC1YGL080W 393 nt9.97□□□□□ -0.81
CSE4P36012 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt9.97□□□□□ -0.81
CSE4P36012 ARG7YMR062C 1326 nt9.97□□□□□ -0.81
CSE4P36012 THI6YPL214C 1623 nt9.96□□□□□ -0.81
CSE4P36012 RCF1YML030W 480 nt9.96□□□□□ -0.82
CSE4P36012 MRPL36YBR122C 534 nt9.96□□□□□ -0.82
CSE4P36012 YHL008CYHL008C 1884 nt9.96□□□□□ -0.82
CSE4P36012 NBA1YOL070C 1506 nt9.95□□□□□ -0.82
CSE4P36012 HXT11YOL156W 1704 nt9.94□□□□□ -0.82
CSE4P36012 YNL234WYNL234W 1281 nt9.94□□□□□ -0.82
CSE4P36012 YJL144WYJL144W 315 nt9.93□□□□□ -0.82
CSE4P36012 YOX1YML027W 1158 nt9.93□□□□□ -0.82
CSE4P36012 YPL168WYPL168W 1293 nt9.93□□□□□ -0.82
CSE4P36012 UME1YPL139C 1383 nt9.92□□□□□ -0.82
CSE4P36012 AI3Q0060 1248 nt9.92□□□□□ -0.82
CSE4P36012 MMS21YEL019C 804 nt9.92□□□□□ -0.82
CSE4P36012 YBL111CYBL111C 2004 nt9.91□□□□□ -0.82
CSE4P36012 YCR049CYCR049C 447 nt9.91□□□□□ -0.82
CSE4P36012 TAF4YMR005W 1167 nt9.91□□□□□ -0.82
CSE4P36012 YPR150WYPR150W 522 nt9.9□□□□□ -0.82
CSE4P36012 DIP5YPL265W 1827 nt9.9□□□□□ -0.82
CSE4P36012 YRF1-2YER190W 5046 nt9.89□□□□□ -0.83
CSE4P36012 ERV2YPR037C 591 nt9.89□□□□□ -0.83
CSE4P36012 ABP1YCR088W 1779 nt9.88□□□□□ -0.83
CSE4P36012 RRP1YDR087C 837 nt9.88□□□□□ -0.83
CSE4P36012 YJR142WYJR142W 1029 nt9.88□□□□□ -0.83
CSE4P36012 ADH6YMR318C 1083 nt9.88□□□□□ -0.83
CSE4P36012 SRM1YGL097W 1449 nt9.88□□□□□ -0.83
CSE4P36012 NPL6YMR091C 1308 nt9.87□□□□□ -0.83
CSE4P36012 NMA2YGR010W 1188 nt9.87□□□□□ -0.83
CSE4P36012 CWC25YNL245C 540 nt9.87□□□□□ -0.83
CSE4P36012 PTH2YBL057C 627 nt9.86□□□□□ -0.83
CSE4P36012 YPQ1YOL092W 927 nt9.86□□□□□ -0.83
CSE4P36012 COA2YPL189C-A 207 nt9.86□□□□□ -0.83
CSE4P36012 BUD31YCR063W 474 nt9.85□□□□□ -0.83
CSE4P36012 CYS3YAL012W 1185 nt9.85□□□□□ -0.83
CSE4P36012 GAT1YFL021W 1533 nt9.85□□□□□ -0.83
CSE4P36012 WSC3YOL105C 1671 nt9.84□□□□□ -0.83
CSE4P36012 CPR2YHR057C 618 nt9.84□□□□□ -0.83
CSE4P36012 MSI1YBR195C 1269 nt9.84□□□□□ -0.83
CSE4P36012 ALG7YBR243C 1347 nt9.83□□□□□ -0.84
CSE4P36012 NDJ1YOL104C 1059 nt9.83□□□□□ -0.84
CSE4P36012 CKI1YLR133W 1749 nt9.82□□□□□ -0.84
CSE4P36012 RRP43YCR035C 1185 nt9.82□□□□□ -0.84
CSE4P36012 STS1YIR011C 960 nt9.82□□□□□ -0.84
CSE4P36012 YOR111WYOR111W 699 nt9.82□□□□□ -0.84
CSE4P36012 LEA1YPL213W 717 nt9.82□□□□□ -0.84
CSE4P36012 INO1YJL153C 1602 nt9.82□□□□□ -0.84
CSE4P36012 MAS2YHR024C 1449 nt9.82□□□□□ -0.84
CSE4P36012 YER147C-AYER147C-A 411 nt9.81□□□□□ -0.84
CSE4P36012 TES1YJR019C 1050 nt9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.7 ms