Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdha1P35486 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdha1P35486 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdha1P35486 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdha1P35486 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdha1P35486 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdha1P35486 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdha1P35486 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.5 ms