Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn3P06796 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn3P06796 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn3P06796 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn3P06796 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn3P06796 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn3P06796 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn3P06796 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csn3P06796 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn3P06796 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csn3P06796 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn3P06796 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn3P06796 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn3P06796 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Csn3P06796 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn3P06796 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn3P06796 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csn3P06796 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms