Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srpk1O70551 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Srpk1O70551 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srpk1O70551 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srpk1O70551 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms