Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD8O14715 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD8O14715 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RGPD8O14715 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
RGPD8O14715 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RGPD8O14715 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RGPD8O14715 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms