Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
USP17L3A6NCW0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP17L3A6NCW0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP17L3A6NCW0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
USP17L3A6NCW0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP17L3A6NCW0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP17L3A6NCW0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP17L3A6NCW0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
USP17L3A6NCW0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP17L3A6NCW0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP17L3A6NCW0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
USP17L3A6NCW0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP17L3A6NCW0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms