Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC39.01■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Camsap1A2AHC3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Camsap1A2AHC3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Camsap1A2AHC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms