Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WVE0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WVE0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A087WVE0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WVE0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms