Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf47Q6ZRZ4 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms