Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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