Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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