Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms