Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 IQUB-201ENST00000324698 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AKT3-203ENST00000366539 5127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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