Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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TRIM63Q969Q1 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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TRIM63Q969Q1 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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TRIM63Q969Q1 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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TRIM63Q969Q1 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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