Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
C4orf17Q53FE4 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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