Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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RTL8BQ17RB0 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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