Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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NECTIN1Q15223 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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NECTIN1Q15223 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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NECTIN1Q15223 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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NECTIN1Q15223 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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NECTIN1Q15223 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NECTIN1Q15223 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
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