Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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GTF2H2Q13888 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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GTF2H2Q13888 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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GTF2H2Q13888 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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GTF2H2Q13888 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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