Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTCH1Q13635 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTCH1Q13635 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTCH1Q13635 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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