Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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