Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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