Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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