Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms