Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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